Las orientaciones nacionales de política del Proyecto Colectivo Ambiental, como parte del Plan Nacional de Desarrollo 1998-2002, están estructuradas alrededor del Agua como eje temático y con base en siete programas centrales, uno de ellos el de Biodiversidad. Los esfuerzos se concentran en ecorregiones estratégicas de importancia nacional, regional y local, como mecanismo para promover y dinamizar el trabajo conjunto entre los diversos entes territoriales y los actores sociales e institucionales alrededor de la prevención del deterioro de los ecosistemas identificados como prioritarios.
