Programa orientado a la generación de información y conocimiento sobre la diversidad biológica marina y costera en su más amplio sentido, así como de los fenómenos y procesos que regulan su existencia, acorde con los conceptos, principios y compromisos de la Convención de Diversidad Biológica y la Política Nacional de Biodiversidad

Los objetivos del programa BEM van acorde a su misión , visión y es asegurado por la alta calidad de su grupo de investigadores, con el fin de contribuir al Plan de Fortalecimiento Institucional

Desde el año 2008, se celebra en Colombia el Día Nacional de los Arrecifes de Coral, una iniciativa del Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial (ahora Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible) que tiene el firme propósito de crear conciencia sobre el delicado estado en que se encuentra y recordar la importancia de este emblemático ecosistema del que se benefician numerosas comunidades en el Caribe y Pacífico colombianos.

En el transcurso del año 2011, el grupo del Sistema Nacional de Monitoreo de Arrecifes Coralinos en Colombia –SIMAC- visitó algunas de las áreas con formaciones coralinas en el Caribe y Pacífico colombianos, con el propósito de llevar a cabo el monitoreo anual que desde 1998 se viene realizando en los principales ambientes coralinos de los mares colombianos.