La Asamblea General está conformada por los siguientes miembros:

• Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible.
• Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación (anteriormente "COLCIENCIAS").
• Armada Nacional.
• Instituto de Investigaciones de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt.
• Instituto de Investigaciones Amazónicas SINCHI.
• Universidad Justus Liebig de Giessen.
• Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano.
• Universidad Nacional de Colombia.
• Universidad de Antioquia.
• Universidad del Valle.
• Corporación Autónoma Regional de los Valles del Sinú y San Jorge - CVS.
• Corporación Autónoma Regional del Valle del Cauca  - CVC.
• Instituto Marino de Flandes - VLIZ
• Conservación Internacional - CI.